Manuel Lima nasceu nos Açores, estudou em Lisboa e no final da licenciatura realizou um estágio em Copenhaga. Posteriormente, entre 2003 e 2005 realizou o mestrado em Design e Tecnologia na Parsons School of Design em Nova Iorque, com o apoio da Fundação Gulbenkian.

O bolseiro Gulbenkian afirma que durante o mestrado descobriu o potencial do design na era digital, nomeadamente a importância da conversão de um enorme volume de dados em estruturas visuais abertas à interpretação, fazendo a ponte entre sabedoria e conhecimento.