

Imagiologia Avançada
A Unidade de Imagiologia Avançada do IGC oferece serviços de microscopia óptica / bioimagem de última geração, com 16 sistemas de confocal/2-fotões, micª de alto-débito, super-res e mesoscopia (folha-de-luz e OPT). Os serviços incluem preparação de amostras, treino em instrumentação e análise de bioimagem (com estações de trabalho e software comercial e gratuito). A AIU é de acesso aberto e serve o IGC, a academia e empresas.
Localização: Ala Bartolomeu Dias
Contactos: +351 214 464 539 @: [email protected]
Os utilizadores da AIU devem seguir os termos de “Uso geral das instalações do IGC” que podem ser consultados aqui (requer login no Agendo).
O “código de conduta” do IGC também contém informações relevantes sobre a conduta esperada no laboratório.
Como evitar uso negligente da AIU?
Qualquer uso negligente deve ser relatado (pelos utilizadores e funcionários) ao coordenador da unidade, que avaliará se o utilizador deve ver negado o uso futuro. O Agendo permite relatar “incidentes” e deve ser utilizado sempre que tais problemas são detectados. Exemplos do que pode ser considerado uso negligente:
O que pode constituir uma contribuição intelectual do pessoal da AIU?
Permitir o acesso a equipamentos, treino e fornecimento de consumíveis, por si só, NÃO garantem co-autoria em publicações de qualquer membro da equipa da unidade.
O ajuda da equipa com aquisição de imagens (imagem “em bruto”, sem pré-processamento), a abertura e conversão para outros formatos genéricos de arquivo, procedimentos básicos de análise (por exemplo, aumento de contraste, medições 2D, segmentação básica e análise básica de partículas) também NÃO constituem uma contribuição significativa que justifique a co-autoria em publicações. Ajuda com desconvolução e outras formas básicas de restauração ou pré-processamento de dados (por exemplo, limpeza de ruído, linearização ou remoção de fundo) também NÃO são consideradas contribuições intelectuais significativas.
As seguintes podem constituir uma contribuição intelectual e portanto devem ser discutidos (a priori ou posteriori) com o coordenador da Unidade e o membro da equipa que fornece(eu) ajuda:
Nesses casos, a equipa deve ser consultada antes (ou durante) a preparação de publicações para garantir que os métodos/resultados são reportados adequadamente. Quando a co-autoria é reconhecida, o autor principal deve obter o acordo prévio do membro da equipa da AIU sobre a sua contribuição e dar-lhe permissão para rever e editar o manuscrito que será submetido a publicação. Sempre que considerado necessário, o “comitê de utilizadores” da AIU será consultado para dar assistência na avaliação da importância de possíveis contribuições intelectuais.
O pagamento dos serviços é sempre devido, mesmo quando a co-autoria é justificada.
Reconhecer a AIU em publicações?
Solicita-se a todos os utilizadores da AIU que reconheçam o apoio do AIU nas suas publicações e comunicações envolvendo qualquer um de nossos instrumentos e serviços, a fim de garantir o financiamento futuro da unidade. Existe um reconhecimento específico para cada instrumento, portanto consulte o SOP/guia do utilizador apropriado. Em todos os casos, deve incluir pelo menos o seguinte: “Agradecemos o apoio do Advanced Imaging Unit (AIU) do IGC, especialmente [inserir nome do(s) funcionário(s) que ajudaram], financiado pelo PPBI-POCI-01-0145- FEDER-022122 (Lisboa 2020/FEDER/FCT; Portugal).”
EQUIPAMENTO















SERVIÇOS & TÉCNICAS
Design experimental; coloração de células e tecidos; preparação de amostras e transparentização de tecidos.
Diagnóstico, reparação e construção de sistemas óticos.
Dependendo da disponibilidade do staff e dimensão do projeto.
ImageJ, QuPath; Imaris, Huygens, Amira e outros - contacte para mais informações.
Varrimento a laser e disco giratório; Airyscan, Lightning e SORA disponíveis.
Intravital, SHG.
Multiposição; mosaicos e montagem; filmagem ao vivo; placas de Petri.
Até 8 em série.
Filmagem de embriões ou organóides in vivo; aquisição de imagens volumétricas 3D de amostras meso e macro transparentizadas, por folha-de-luz (fluorescentes) ou OPT (fluorescentes ou sem marcação).
SIM-SR e Apotome.
STORM/PALM/TIRF
Para CLEM, consulte EMF.
Ablação, FRAP, FLIP, FRET(AB/SE).
RECURSOS ÚTEIS
Microscopy Primer (conceitos básicos de microscopia)
COLife & friends - Webinars 2021 sobre Imagiologia
FPbase (espectros de fluorescência)
(fluorescência) Spectraviewer
Biii.org (recursos de análise de bioimagem)
Sea4Bia (scripts/macros dos laboratórios PPBI)
NEUBIAS Academy @Home (tutoriais de análise de bioimagem)
Confocal-list (forum)
Image.Sc (forum)
EQUIPA
PUBLICAÇÕES
Ver artigos científicos aqui.
MEDIA
Financiamento
Parceiros