O grupo de investigação está particularmente interessado em estudar e quantificar o papel que as defesas do sistema imunitário têm no controlo de infeções bacterianas, e na mitigação da crescente resistência a antibióticos por parte dos micro-organismos durante os tratamentos. Combinando a análise matemática com simulações, estão também interessados na dinâmica populacional, processos estocásticos e problemas de inferência de parâmetros oriundos de diferentes áreas transversais da biologia. As descobertas advindas destes modelos matemáticos, podem ter implicações a nível da prática biomédica e na saúde pública. Atualmente, o grupo de investigação colabora com diferentes grupos de investigação em Portugal (IMM Universidade Lisboa) e no estrangeiro: colaborações em França (Universidade de Tours) e nos Estados Unidos da América (Universidade de Tennessee, Universidade de Michigan).