PONTE Programa Pós-doutoral em Biologia Quantitativa Teórica

Um programa para doutorados em física, matemática, engenharia ou uma disciplina relacionada, para realizar investigação em biologia quantitativa teórica de mãos dadas com experimentalistas.

Bolsas que ligam as ciências exatas à biologia

 O Instituto Gulbenkian de Ciência convida doutorados em física, matemática ou disciplinas relacionadas a candidatarem-se ao novo programa de bolsas PONTE. Os bolseiros do programa PONTE terão um papel preponderante no que toca à missão do instituto de estabelecer uma ponte entre a biologia e as ciências exatas.

Com este propósito, os bolseiros são encorajados a trabalhar independentemente, desenvolvendo projetos em colaboração com membros de um ou vários grupos de investigação do IGC. Para ir ao encontro dessa independência, as bolsas PONTE têm uma duração de três anos. Durante este período, os bolseiros usufruem de excelentes condições de trabalho e irão desempenhar um papel fundamental no desenvolvimento da biologia quantitativa teorética no IGC.

Candidaturas

 

As bolsas

Os bolseiros PONTE serão designados para um período inicial de dois anos, com a possibilidade de extensão por um terceiro ano. De forma a facilitar a sua estadia no IGC, os bolseiros serão apoiados com:

  • Financiamento de equipamento informático
  • Subsídio de relocalização
  • Cobertura dos sistemas de saúde público e privado
  • Data de inicio flexivel

Além disso, para promover o sucesso da sua investigação, os bolseiros PONTE terão a possibilidade de:

  • Aceder aos serviços computacionais
  • Financiamento anual para viagens e para acolher visitantes
  • Acolher um orador por ano
  • Organizar a Escola de Inverno PONTE em biologia quantitativa
  • Associar-se ao programa de doutoramento em Biologia Integrativa, envolvendo-se no processo de seleção dos bolseiros

 

Os bolseiros

Após a chegada, espera-se que os bolseiros PONTE interajam com diferentes grupos de investigação, frequentem reuniões de grupo, participando no debate com membros do grupo, etc. Depois deste período inicial exploratório ( e com a assistência dos coordenadores do programa quando necessário), os bolseiros devem delinear um programa de investigação. Espera-se que a investigação dos bolseiros seja colaborativa, envolvendo grupos locais. Projetos colaborativos que envolvam dois ou mais grupos de investigação são particularmente bem-vindos.

Para além de desenvolverem a sua investigação, espera-se que os bolseiros PONTE sejam membros ativos da comunidade do IGC. Para este fim, irão assistir e participar nos seminários, bem como convidar oradores e aumentar a exposição à biologia teorética no IGC.

 


Lorenzo Fant
Bolseiro PONTE, 2022

Lorenzo é pós-doutorado e trabalha em ecologia teórica e evolução. Tem formação em física teórica e obteve seu doutoramento no SISSA (em Itália) com a tese sobre “Ecologia estocástica e evolução em comunidades bacterianas”. Integrou o IGC após um breve pós-doutoramento na Universidade de Granada. O seu principal interesse de investigação é a modelação de fenómenos eco evolutivos, seguindo abordagens teóricas e baseadas em dados. Foca-se principalmente em dois aspetos da ecologia e da evolução: a caracterização do estado estável das comunidades ecológicas em equilíbrio evolutivo e, por outro lado, os efeitos da estocasticidade ambiental e das interações ecológicas na evolução das características individuais.

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Adolfo Alsina
Bolseiro PONTE, 2021

Estudou Matemática e Física na Universidad Complutense de Madrid (UCM) e fez um mestrado em Soft Matter and Biological Physics (École Normale Supérieure – ENS). Após realizar um estágio na Universidade de Ciência e Tecnologia de Hong Kong (HKUST), mudou-se para a Alemanha para fazer um doutoramento no Max Planck Institute for the Physics of Complex Systems (MPIPKS). Estuda os sistemas biológico recorrendo a métodos de física estatística de não equilíbrio, aprendizagem automática e processos estocásticos, com foco no comportamento coletivo como resultado de interações multi-escala complexas. 

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David Soriano-Paños
Bolseiro PONTE, 2021

É doutorado pela Universidade de Zaragoza, onde obteve também o bacharelado e o mestrado em física em 2016 e 2017, respetivamente. A sua investigação centra-se no estudo de sistemas complexos através das lentes da física estatística, dinâmica não linear e ciência de redes, especialmente com foco na interação entre a mobilidade humana e a propagação de doenças transmissíveis.

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O ambiente

O Instituto Gulbenkian de Ciência acolhe grupos de investigação de diversas áreas da biologia, desde comportamento animal até à evolução microbiana e à biofísica teorética. O instituto conta com serviços científicos de excelência, incluindo microscopia eletrónica, imagiologia avançada, citometria de fluxo, entre outros.

Os serviços computacionais incluem:

  • biodata cluster: 16 nodes, each with 20cores and 128GB RAM, plus 2 nodes with 20cores and 1.5TB RAM. All this attached to over 100TB of SSD storage.
  • slurm cluster: 4 nodes, each with 64 cores and 512 GB RAM plus 12TB of SSD scratch space. 

Para além disso, o instituto tem um excelente historial de financiamento de organizações internacionais como ERC, EMBO, HFSP e outras.

Além do seu amplo espectro científico, o instituto é palco de um ambiente cultural altamente diversificado, com mais de 44 nacionalidades, e um rácio 56% de mulheres. O Instituto Gulbenkian de Ciência tem uma localização priveligiada na cidade costeira de Oeiras, a 15 minutos de Lisboa através de transportes públicos.

 

Bolseiros anteriores

Tendo em conta que o programa PONTE é uma iniciativa recente, este não tem ainda Alumni. No entanto, antes deste programa, o IGC promovia um programa precursor (Biology by Numbers) com a duração de dois anos. Os investigadores pós-doutorados selecionados frequentaram cursos avançados de biologia por um semestre e tiveram a oportunidade de iniciar estudos de biologia quantitativa ao longo de outro semestre.

 


Estefanía Munoz Hoyos
Bolseira Biology by Numbers, 2020

Estefanía fez o doutoramento na Universidade Nacional da Colômbia e o mestrado na Universidade de Brasília. A sua investigação focou-se na modelação de sistemas ecológicos sujeitos a variáveis climáticas através de uma combinação de ferramentas estocásticas, físicas e numéricas. Enquanto no IGC obteve formação em Ciências Biológicas e desenvolveu um projeto de investigação sobre como a simbiose planta-micróbio alarga a gama de habitabilidade do Daisyworld. Atualmente, tem um pós-doutoramento no Instituto Max Planck de Biogeoquímica da Alemanha, onde estuda a troca carbono-água sob concentração estocástica de CO2 atmosférico. 

 


Cécile Carrère
Bolseira Biology by Numbers, 2019

Cécile estudou Matemática na ENS Cachan e obteve o seu doutoramento em Matemática Aplicada na Aix-Marseille Université. A sua investigação focou-se na otimização de esquemas de quimioterapia usando a teoria do controle ideal, tendo realizado posteriormente um pós-doc no mesmo tópico na Universidade de Sorbonne. No IGC colaborou com o Laboratório de Sinalização Bacteriana. Desde 2020, é Maitre de Conférence (professora assistente) na Université d’Orléans. A sua investigação foca-se nas populações estruturadas na microbiota intestinal, estudando a sua distribuição fenotípica e espacial.

 


Atualização em 26 setembro 2023

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