Genómica Microbiana e Simbiose

Waldan Kwong

O grupo interessa-se pela ecologia, evolução e função dos microrganismos: como se tornaram tão diversos e bem-sucedidos? O que lhes permite formar comunidades complexas entre si e com eucariotas multicelulares? Como podemos beneficiar das suas tremendas inovações evolutivas?

Atualmente, o Laboratório de Genómica Microbiana e Simbiose utiliza as abelhas sociais como sistema modelo para investigar estas questões. As abelhas sociais, incluindo as abelhas melíferas e os zangões, possuem uma microbiota intestinal simples, mas única, que só recentemente foi descrita e ainda é pouco conhecida. Trabalhamos para compreender a função e a história natural desses micróbios, através do desenvolvimento de ferramentas genéticas, conjuntos de dados genómicos e coleções de culturas. Como polinizadores prolíficos de plantas, as abelhas são essenciais para sustentar os ecossistemas naturais e a agricultura humana. Compreender a relação com os seus micróbios intestinais simbióticos ajudará a descobrir maneiras de melhorar a saúde e apoiar a conservação destes importantes insetos.

O laboratório investiga também outros microbiomas pouco estudados, como as comunidades protistas associadas a corais e outros sistemas marinhos, utilizando sequenciação de amplicons, metagenómica e transcriptómica de célula única. Ao ampliar a nossa visão das simbioses microbianas, estes sistemas ajudam-nos a compreender as diversas maneiras pelas quais os microrganismos evoluíram para interagir e prosperar no seu ambiente.

 


Financiamento

      FCT


Projetos

As comunidades de micróbios (microbiomas) têm um papel importante na saúde dos seus animais hospedeiros. Apesar da sua importância na manutenção de um microbioma saudável, pouco se sabe sobre como as comunidades microbianas se formam e prosperam. Este projeto financiado pela EMBO tem como objetivo compreender os fatores genéticos subjacentes à organização do microbioma, utilizando para isso um sistema modelo (abelhas sociais) que mimetizam vários aspetos de sistemas mais complexos como o microbioma humano.

O projeto irá explorar duas áreas principais:

  • O papel de fatores de interação célula-célula entre membros do microbioma e
  • Como estes fatores variam em diferentes ambientes, populações de hospedeiros, e entre espécies de hospedeiros.

Utilizando uma abordagem inovadora e métodos interdisciplinares, incluindo genómica de alta performance, microscopia, e experiências in vivo, este projeto integra descobertas em várias escalas, do nível molecular aos níveis ecológico e evolutivo. Em última análises este trabalho irá desvendar aspetos importantes sobre a formação e a perseverança de comunidades de micróbios estáveis e revelar novas formas de melhorar a resiliência do microbioma face a invasores patogénicos e a perturbações ambientais. Além disso, a investigação terá várias implicações em todas as áreas onde o microbioma desempenha papéis importantes, nomeadamente na agricultura, na medicina e na biotecnologia.

Data início:  janeiro 2022                   |                Financiamento obtido: 50.000 €


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